Деревня Коноха подвергается нападению коварного кицунэ. Чтобы избавить жителей от уничтожения, старейшина заключает лиса в тело своего новорожденного сына, пожертвовав собой. Подрастающего малыша побаивается население, ведь в нем сидит запечатанный демон.
Но мальчик пытается совершать добрые поступки, которые помогут ему завоевать доверие окружающих. В 12 лет он поступает на обучение к сенсею Хатакэ. Мастеру нравится рвение нового ученика, и он вкладывает в него максимум усилий. Наруто мечтает стать Хокагэ, как отец, и жадно впитывает знания. Вместе с одноклассниками Саскэ и Харуной он образует команду, которая помогает односельчанам в мелких проблемах.
Но вскоре над Конохой вновь нависает угроза. В поселении объявляется беглый ниндзя Оротимару, способный вселяться в чужое сознание. Он убивает Третьего Хокагэ и начинает терроризировать народ. Преступник желает заполучить молодое, необученное тело, и лучшим кандидатом становится Саскэ. Наруто и его друзьям необходимо избавиться от узурпатора.