Синъити Кудо вырос ответственным и серьезным парнем. Он был поборником справедливости, а потому уже в семнадцать лет делал все возможное, чтобы искоренить преступность. Вмешательство в дела бандитов в один из дней изменило жизнь Кудо до неузнаваемости.
Понятно, что злодеи были сильнее парнишки, а потому схватили его и заставили проглотить какую-то таблетку. Герой и представить не мог, что под ее действием превратится в семилетнего мальчишку. Очнувшись от первого шока, он решил обратиться за помощью к профессору Агасе, считавшемуся непревзойденным гением. Но, выслушав историю парня, тот лишь развел руками. Никогда раньше ученому не приходилось иметь дело ни с чем подобным.
Вариантов для решения проблемы пока не было, и Кудо отправился к Когоро Мори, семью которого знал с детства. Там жила его лучшая подруга, к счастью, она не подозревала, что в образе маленького мальчика по имени Эдогава Конан скрывается ее друг. С помощью Когоро, имевшего немалые связи, герой надеялся отыскать бандитов, чтобы вернуть своей прежний облик.